Autorité des religieux

Désormais dédoublée pour chaque groupe, la figure du grand rabbin jouit d'une autorité considérable auprès de ses fidèles. De par sa fonction de président du tribunal rabbinique, il veille au respect de la loi mosaïque, s'appuyant sur le Talmud ainsi que sur le Choulhan Aroukh, un commentaire du Talmud. Les juridictions rabbiniques traitent des affaires de statut personnel mais aussi civiles et commerciales lorsque seuls des Juifs sont concernés, que les fautes soient religieuses ou profanes. Dans les petites villes, c'est un rabbin-juge qui est chargé de rendre la justice, le tribunal rabbinique servant alors de chambre d'appel. L'une des peines les plus rigoureuses que ce dernier puisse prononcer est l'excommunication du condamné (herem), rendue publique dans la synagogue, et qui cause sa mise au ban de la communauté.
Toutefois, certains remettent alors en cause l'autorité des chefs religieux. C'est le cas d'un courtier juif travaillant pour une maison de commerce française qui est condamné à la bastonnade en mai 1827 pour avoir invoqué le nom de Dieu. Il obtient ensuite du consul de France qu'il émette une protestation auprès du bey qui promit que le tribunal rabbinique ne prononcerait plus de peine pour délit religieux à un Juif placé sous la protection française.